2018年度「先進ゲノム支援」情報解析講習会のご案内
プログラミング言語「Python」を用いたRNA-seqデータの視 覚化や多変量解析等のプログラミング実習を中心とした中級者向け情報解析講習会 受講者募集

開催日時

2018年11月19日(月)13:00 ~ 11月21日(水)13:00

開催場所

国立遺伝学研究所(静岡県三島市谷田1111)

内容

「先進ゲノム支援」(先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム)は、文部科学省科学研究

費助成事業の新学術領域研究『学術研究支援基盤形成』 において、最先端のゲノム解析及

び情報解析技術を提供して我が国のゲノム科学ひいては生命科学のピーク作りとすそ野拡

大を進めることを目指し、2016年4月から支援活動を開始しています。

「先進ゲノム支援」では支援活動の一環として情報解析講習会を開催しています。今年度は、

中級者向けの講習会として、プログラミング言語「Python」を用いたRNA-seqデータの視

覚化や多変量解析等のプログラミング実習を中心に、以下の要領で情報解析講習会を開催

いたします。



◆募集人員: 若手研究者20名程度(想定スキルレベル:情報解析中級者)

  ・これから自分で実践的にプログラミングをしようと考えている方。

  ・基本的なLinuxコマンドは身につけていることを前提とします。



◆参加費: 無料



◆講習会スケジュール(予定):

【11月19日;1日目】

 13:00-13:10 講習会説明

 13:10-14:30 バッチジョブ、RNA-seqの各種ツールによる解析

 14:40-16:10 Pythonの基本文法

 16:20-17:50 文字列処理、ファイルの読み書き、正規表現

【11月20日;2日目】

 10:00-11:30 Jupyter notebook、Biopython

 11:40-13:00 表形式ファイルの処理(Pandas)、RNA-seqデータの補正

 13:00-13:50 昼食休憩

 13:50-15:20 視覚化 (matplotlib, seaborn)

 15:30-17:00 統計的仮説検定

【11月21日;3日目】

 10:00-13:00 多変量解析(PCA, MDS, 階層的クラスタリング等)



◆申し込み〆切: 2018年10月16日(火)



◆募集詳細: 申込方法等、詳細につきましては以下のURLをご覧ください。

https://www.genome-sci.jp/whatsnew/event/news20180920.html



主催者

文部科学省科学研究費助成事業
新学術領域研究『学術研究支援基盤形成』
「先進ゲノム支援」(先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム)

URL

https://www.genome-sci.jp/whatsnew/event/news20180920.html

問い合わせ先

先進ゲノム支援事務局
genome-sec@genome-sci.jp
https://www.genome-sci.jp/