アップデートされたOrchidBase 2.0は、ラン科内の5亜科に属する以下の10種の花で発現している1,562,071個のunigeneの情報を含んでいる。
Apostasia shenzhenica、Neuwiedia malipoensis (Apostasioideae亜科)、Vanilla shenzhenica、Galeola faberi (Vanilloideae亜科)、Paphiopedilum armeniacum、Cypripedium singchii (Cypripedioideae亜科)、Habenaria delavayi、Hemipilia forrestii (Orchidoideae亜科)、Phalaenopsis equestris、Cymbidium sinense (Epidendroideae亜科) (一部写真)。
OrchidBaseは、さらに遺伝子の一般情報に関する詳細なアノテーション、相対的な発現レベル、遺伝子オントロジー、KEGGパスウェイマップ、遺伝子ネットワーク予測も含んでいる。ORchidBase 2.0はhttp://orchidbase.itps.ncku.edu.tw/で無料公開。
中央の図式はアノテーション、解析の事例。
Li-Jun Chen、Zhong-Jian Liu (The National Orchid Conservation Center of China and The Orchid Conservation & Research Center of Shenzhen, Shenzhen, China)、Tun-Yu Chen (Department of Life Sciences, National Cheng Kung University, Taiwan)
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