カリンさん：

みんなの広場のご利用ありがとうございます。

同じカボチャからとった種子なのに発芽したり発芽しなかったりするものがあったのは不思議ですね。このお答えは登録番号2324をご覧になればおわかりですが、もう一度要約します。

まず、食用に買ってくるカボチャは未熟です。未熟というのはなかにある種子が十分に成熟していない恐れがあると言うことです。2324にもありますが、カボチャの種子は取り出した直後は多く休眠しています。休眠というのは、種子でも、芽（秋に枝のできる冬芽など）でも出来たてのときはすぐ発芽しないように眠った状態になっていることです。眠りの状態はいろいろで、未熟種子の休眠は深く、成熟した種子の休眠は浅いか、眠りから覚めたものもあるはずです。カリンさんが切った食用のカボチャは比較的未熟なので、なかの種子の成熟度もいろいろだったと思います。つまり、取り出した種子の形は同じようでも成熟度が違い、まだ休眠しているもの休眠から覚めたものが混ざっていたのではないかと思います。そのため発芽したもの発芽しないものが出てきたと思われます。もう一つの原因は、種子の皮（固いから）に発芽を妨げる物質が含まれていることす。根だけ出て茎が伸びなかったものなどはこの物質のためかもしれません。種子の発芽はふつう根が先に出てきます、眠りから覚めていたので発芽し始めたのですが種子のからにあった抑制物質が溶け出してきて働きそれ以上成長できなかったためと思われます。1つの入れ物に沢山の種子をまくと発芽しなくなるのもこの発芽抑制物質のためでしょう。種子をまくと、からに含まれていた発芽抑制物質が溶け出してきます。沢山の種子をまくとこの発芽抑制物質の濃度が高くなりますね。そのために発芽できなくなるのです。種子同士のけんかとも言えますね。
このような種子（黒皮ヒマワリ、スイカなど）はたくさんあります。カリンさん、種子の固いからを上手にむくと胚（胚）と呼ばれるカボチャの赤ちゃんが出てきます。
この胚をまいてみてください。おそらくほとんどが発芽するのではないかと思います。ついでに一言、カボチャの胚は炒って食べると香ばしくて美味しいですよ。